Développeuse-analyste ou développeur-analyste en ressources informationnelles, Génomique, ¿ Niveau 3

Description du poste

La Faculté des sciences de l’agriculture et de l’alimentation (FSAA) est la seule faculté francophone en Amérique dans le domaine de l’agriculture, de l’alimentation, de la nutrition et de la consommation. Notre mission est de former des professionnels.elles et des chercheurs.es hautement qualifiés. La FSAA est une entité de calibre mondial, axée sur le développement des connaissances et des compétences par l’enseignement et la recherche, dans la perspective de proposer des solutions innovantes, inclusives et durables aux besoins émergents du secteur des sciences et du génie bioalimentaire, de la nutrition et de la consommation pour répondre aux préoccupations sociétales et de santé.

Ce contrat est sous octroi. La personne recherchée sera un pivot significant pour l’équipe de recherche « Genovalia » du professeur Claude Robert du département des sciences animales. À titre de personne responsable du volet RI pour l’équipe de recherche, elle aura les responsabilités suivantes :

Gestion de l'écosystème et valorisation sémantique des données de recherche

- Mise en œuvre des principes FAIR (Focus Découvrabilité) : Structuration des données de recherche complexes (génomique non humaine, agroalimentaire, environnement) pour s'assurer qu'elles soient repérables, accessibles et exploitables de manière autonome par les machines et les chercheurs à l'échelle internationale.
- Standardisation via le standard DCAT (Data Catalog Vocabulary) : Application rigoureuse de la spécification DCAT pour décrire précisément les catalogues de données de Genovalia,



permettant ainsi leur indexation et leur moissonnage automatique par les grands répertoires canadiens et internationaux.
- Modélisation sémantique avancée (RDF, JSON-LD, SPARQL) : Conception de graphes de connaissances interconnectant les métadonnées de recherche afin de briser les « silos muets » de données et de préparer la plateforme aux projetsd'intelligence artificielle et d'apprentissage automatique.
- Intégration d'ontologies spécialisées (FoodOn & Phenopackets) : Application de standards sémantiques stricts, notamment FoodOn (pour standardiser les données sur l'agroalimentaire, l'agriculture et la nutrition) et Phenopackets (pour le phénotypage clinique et la génomique), garantissant une interopérabilité sans faille des jeux de données hautement hétérogènes.
- Automatisation du catalogage et gouvernance : Développement de pipelines pour l'ingestion automatique et la validation des métadonnées, tout en encadrant les règles de gouvernance (définition des droits d'accès, attributionchercheurs partenaires.

Liaison technique et collaboration pancanadienne

- Animation technique bilingue : Représentation technique de Genovalia et animation des discussions scientifiques et d'ingénierie avec des équipes universitaires francophones et anglophones d'un bout à l'autre du Canada.
- Vulgarisation et « traduction » technologique :



Traduction et vulgarisation des concepts informatiques et d'architecture de données complexes pour les rendre accessibles et compréhensibles auprès des chercheurs, biologistes,partenaires d'affaires et gestionnaires non techniques. Inversement, traduction des besoins scientifiques et opérationnels de ces acteurs en spécifications et exigences techniques claires pour les équipes de développement.
- Négociation et consensus sémantique : Rapprochement et harmonisation des manières de décrire et de structurer les données entre différentes universités afin de converger vers des standards technologiques communs et partagés.

Architecture et développement logiciel

- Coordination technologique : Direction et coordination du développement technique des projets de Genovalia, incluant l'accompagnement personnalisé des développeurs et des chercheurs dans la traduction de leurs besoins scientifiques en solutions logicielles.
- Conception et développement d'API modernes : Programmation d'interfaces de programmation applicative performantes et sécurisées (FastAPI, Django, Python) spécialement optimisées pour l'accès, l'exploration et la gestion sécurisée des données génomiques.
- Veille technologique et innovation : Évaluation continue des nouveaux outils, architectures et bibliothèques (notamment l'intégration des modèles d'IA et de Machine Learning) afin de maintenir l'avantage concessionnel et la modernitéde la plateforme Genovalia.

Infrastructure, systèmes et DevOps

- Administration système et bases de données : Gestion opérationnelle, maintenance et optimisation continue des bases de données (PostgreSQL, MongoDB) et des serveurs de production.
- Architecture Cloud & Hybride

📌 Développeuse-analyste ou développeur-analyste en ressources informationnelles, Génomique, ¿ Niveau 3 (Canada)
🏢 Université Laval
📍 Canada