De la séquence à la clinique - amélioration du diagnostic de leucémie par l’utilisation de séquençage de 3e génération Réf ABG-140524 Sujet de Thèse
13/10/2026 Autre financement public
Centre de Recherche Azrieli du CHU Sainte-Justine (Université de Montréal)
Lieu de travail Montréal - Canada
Intitulé du sujet De la séquence à la clinique - amélioration du diagnostic de leucémie par l’utilisation de séquençage de 3e génération
Champs scientifiques Biotechnologie
Santé, médecine humaine, vétérinaire
Science de la donnée (stockage, sécurité, mesure, analyse)

Mots clés Séquençage, leucémie, translation, bio-informatique, analyse de données Description du sujet Dans une optique d’amélioration de la trajectoire des patients, un vaste projet de recherche reposant sur des données de séquençage de nouvelle génération est en cours. Celui-ci comporte de nombreuses sous-questions auxquelles répondre et plusieurs autres projets pourraient venir s’y greffer en fonction des données générées et des besoins évolutifs du laboratoire.
Séquençage de l’(épi)génome et de l’(épi)transcriptome par Nanopore Grâce à d’importantes subventions de recherche, le laboratoire génère actuellement des données de séquençage du génome et du transcriptome pour une vaste cohorte de patients en oncologie, en utilisant la technologie Nanopore. Cette approche permet le séquençage simultané des modifications des acides nucléiques. Ainsi, les génomes obtenus inclus l’épigénome et les transcriptomes obtenus inclus l’épitranscriptome. Les personnes retenues seront amenées à effectuer l’analyse et la caractérisation de ces profils génomique,



épigénomiques, transcriptomiques et épitranscriptomiques à des fins diagnostiques et pour divers sous-groupes de cancer pédiatrique, similairement aux travaux de doctorat du Dr Lavallée.
Prise de fonction : Nature du financement Autre financement public
Précisions sur le financement Fonds de recherche du superviseur
Présentation établissement et labo d'accueil Centre de Recherche Azrieli du CHU Sainte-Justine (Université de Montréal)
Le laboratoire du Dr Lavallée s’efforce de mieux comprendre les anomalies génomiques menant au cancer, dans le but d’accélérer le diagnostic chez les patients atteints. Pour ce faire, il recourt à des technologies de pointe telles que le séquençage utilisant la technologie Nanopore. Le laboratoire bénéficie également d’un riche ensemble de données multi-omiques, générées au cours des dernières années par séquençage du génome et du transcriptome, tant en mode conventionnel qu’à l’échelle unicellulaire. L’intégration de ces approches permet de révéler avec une précision accrue la diversité cellulaire et génomique caractéristique des leucémies.
Doctorat en Sciences biomédicales, biochimie, bio-informatique ou biologie moléculaire
Pays d'obtention du doctorat Etablissement délivrant le doctorat Université de Montréal
Profil du candidat Un intérêt pour l’analyse informatique et l’interprétation biologique de données est nécessaire.
La personne recrutée devra être en mesure de travailler de façon autonome et en recherchant le soutien nécessaire auprès des ressources disponibles au sein du laboratoire.
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📌 De la séquence à la clinique - amélioration du diagnostic de leucémie par l’utilisation de séquençag (Quebec City)
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