28 Aug
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Ferlab - Centre de recherche du CHU Sainte-Justine
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Montreal
28 Aug
Ferlab - Centre de recherche du CHU Sainte-Justine
Montreal
Ferlab| Gnie logiciel Une quipe du CHU Sainte-Justine Au service des enfants atteints de maladies rares, cancers et autres conditions mdicales graves, les applications et technologies que nous dveloppons servent optimiser lutilisation des donnes massives de sant pour la recherche et ainsi contribuer lamlioration des traitements et diagnostics des petits patients du CHU Sainte-Justine et partout dans le monde.
Dveloppeur | Logiciel enbioinformatique Une carrire compltement diffrente Notre quipe sagrandit ! Vous dsirez mettre votre exprience en dveloppement de logiciels au profit de la causeet ainsi contribuer positivement la socit ? Cest dans une atmosphre dentraide et dharmonie que nous faisons avancer les mandats qui nous tiennent cur.
Votre rle Libre dans vos fonctions Vous tes autonomes et prenez vos responsabilits cur.
Positif, cratif et ouvert aux ides nouvelles, vous faites preuve de flexibilit afin de raliser votre mission.
Cration, gestion et maintenance des pipelines danalyse des donnes gnomiquesselon les standards
Nextflow/nf-core(DSL2, modules, configurations),dans diffrents types denvironnements (HPC,CLoud,Kubernetes).
Concevoir, corriger et tester diverses fonctionnalits et outils en lien avec les pipelines ainsi que la gestion des donnes gnomiques.
Amliorer la qualit du code et des applications par lcriture de tests.
Effectuer le benchmarking, la validation et le suivi de performance des pipelines sur des jeuxde donnes rfrence.
Agir commepersonne ressourceenbioinformatiqueet enomiquepour le reste de lquipe.
Participer aux revues de code (codereviews) des autres membres de lquipe.
Proposer des solutions damlioration et davancement technologique pour les diffrents projets et le stack techno en gnral.
Participer la documentation des diffrents processus.
Nos stacks techniques Au-devant du march Chez
FerLabtoutes les applications que nous crons sont code source ouvert sur
GitHub, nous privilgions dailleurs lutilisation de logiciels
Open Source.
Agile, nous sommes toujours ouverts explorer de nouvelles technologies et faons de faire. la recherche des meilleures solutions, nous travaillons avec les plus rcentes technologies tellesque: Nextflow,Kubernetes, Docker, Python, Spark, R, SQL,Elasticsearch, Git,Github, Oauth2,Keycloak, AWS,Openstack, JWT, REST et autres outils dintgration continue.
Parce que vous faites une diffrence Nous voulons aussi en faire une pour vous Nous vous offrons des conditions qui s''harmonisent parfaitement avec vos obligations personnelles, pour vous faciliter la vie et non linverse ! Tltravail ou prsentiel vous dcidez selon ce qui vous convient le mieux. 35 heures semaine vous aurez une grande flexibilit dans votre horaire.
Slection libre des vacances vous dbutez avec 4 semaines. 9.6 jours de congs maladie pays (3 en journes personnelles) toujours pratique quand lcole ferme ou que le petit dernier a le nez qui coule. 13 jours fris - au lieu de 10 (tel que prvu par la CNESST) ici, on a 3 raisons de plus de clbrer ! On vous offre un fonds de pensionbien gnreux lun des meilleurs sur le march, rien de moins.
Un rgime dassurance collective et un programme daide aux employs pour vous et votre famille.
Une garderie sur place pour les parents qui souhaitent travailler en prsentiel.
Et,
vous tes libre de choisir votre environnement de travail - Linux ou Mac! Pour former une quipe unie Pas besoin dtre expert en biologie ou en mdecine pour faire partie de notre quipe, lessentiel est de: Possder une maitrise ou un doctoratenbioinformatique,biologie computationnelle,informatiqueou domaine quivalent.
Connaissance de labioinformatiqueet la gnomique (obligatoire).
Avoir une excellente connaissance des formats de donnes utiliss en gnomique (FASTQ, BAM, CRAM, VCF,gVCF,etPLINK).
Exprience dmontre avec
Nextflowet les conventionsnf-core(DSL2).
Exprience pratique avec au moins deux types de donnesomiques(WGS/WES, RNA-seq, single-cell, long-read, ATAC,etc..).
Maitrise des conteneurs (Docker,Singularity/Apptainer) et dun ordonnanceur HPC (SLURM).
Exprience en transcriptomique (un atout).
Avoir de lexprience professionnelle en dveloppement logiciel. laise avec la culture de revue de code (codereviews).
Capacit communiquer des conceptsbioinformatiques un public non spcialiste (cliniciens, dveloppeurs, gestionnaires).
Rigueur en communication technique (README, documentation de modules, dcisions darchitecture). tre confortable dans un environnement agile et collaboratif La maitrise du franais tant loral qu lcrit est essentielle pour ce poste.
Cette offre demploi sadresse exclusivement aux personnes rsidant actuellement au Qubec.
Les candidatures provenant de lextrieur de la province ne seront pas considres Avoir lesprit technique et en mode solution tre curieux et aimer apprendre tre aussi passionn de la cause quenous! Compos de plus de 200 chercheurs reconnus, le Centre hospitalier universitaire Sainte-Justine est le plus grand centre mre-enfant au Canada et lun des plus importants en Amrique.
📌 Développeur -Logiciel en bioinformatique (Montreal)
🏢 Ferlab - Centre de recherche du CHU Sainte-Justine
📍 Montreal