Professionnel(le) de recherche en biologie computationnelle - [E-850]

Professionnel(le) de recherche en biologie computationnelle - [E-850]

08 Oct
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Centre de recherche du CHU de Québec - Université Laval
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Quebec

08 Oct

Centre de recherche du CHU de Québec - Université Laval

Quebec

Vous avez envie d’évoluer au sein du plus grand centre de recherche francophone en Amérique du Nord et de participer à des projets de recherche des plus stimulants? Le Centre de recherche du CHU de Québec-Université Laval est une organisation qui offre un environnement de travail stimulant où les nouvelles idées, le partage des connaissances et le dépassement de soi sont valorisés.



On estime qu’environ 6 000 à 7 000 maladies rares différentes ont été répertoriées à travers le monde.



Les maladies rares peuvent affecter à la fois les capacités physiques, mentales, comportementales ou sensorielles des individus. L’impact sur l’espérance de vie diffère considérablement d’une maladie rare à l’autre :

certaines entraînent le décès à la naissance, plusieurs sont dégénératives ou menacent la vie, alors que d’autres sont compatibles avec une vie normale si elles sont diagnostiquées de façon précoce et prises en charge de façon appropriée. Il est à noter que près de 75 % d’entre elles affectent les enfants. Environ 80 % des maladies rares sont d’origine génétique, les autres causes étant environnementales (tératogène, infection, intoxication) ou dans plusieurs cas, d’origine encore inconnue.



Il y a un impact majeur des maladies rares sur la santé de la population 7,8. La présence d’une maladie rare est associée à une morbidité et une mortalité accrue : jusqu’à 30 % des enfants atteints de ce type de maladie décèdent avant 5 ans. La rareté de ces maladies (moins de 1 personne atteinte sur 2 000) crée des obstacles particuliers dans notre système subventionnaire de recherche, du fait que le nombre de patients est peu élevé, ce qui représente un marché restreint pour les compagnies pharmaceutiques. Ces obstacles causent des retards et des lacunes dans la compréhension de ces maladies, les diagnostics, les traitements, les soins spécifiques, et l’information disponible aux familles touchées.



Considérant la situation actuelle des maladies rares, une équipe de chercheurs a décidé de mettre sur pied un ambitieux programme de recherche qui viendra combler certaines lacunes dans les connaissances : le Programme de Recherche et Innovation Sur les Maladies rarES (PRISMES). Ce programme permettra d’identifier et de caractériser certaines dysfonctions moléculaires associées à des maladies rares et de créer une ressource pour les recherches futures (biobanque). Des enfants et jeunes adultes atteints de maladies rares (cas index), ainsi que leurs apparentés atteints ou non atteints, seront recrutés afin de procéder à l’analyse génétique de leur ADN. Cela devrait permettre d’identifier la cause génétique de certaines de ces maladies. De plus, des analyses fonctionnelles à l’aide de modèles in vitro et in vivo portant sur des mutations et gènes identifiés permettront d’étudier plus profondément les mécanismes cellulaires et moléculaires impliqués dans le développement de la maladie. En plus de fournir des nouvelles connaissances scientifiques sur l’identification et les mécanismes des maladies rares, les résultats des recherches de PRISMES pourraient éventuellement être utilisés par toute la communauté scientifique, par exemple mettre en évidence de nouvelles cibles qui pourraient contribuer au développement de nouvelles approches thérapeutiques, ou optimiser le transfert des connaissances acquises vers le milieu clinique afin d’améliorer les services aux familles touchées par les maladies rares.



Description du poste, des tâches et des responsabilités



La personne sera en charge de :



1) Superviser les professionnels de recherche ;

2) Prendre en charge le processus méthodologique en bioinformatique ;

3) Contribuer à la rédaction d'article scientifique et de demandes de subventions par la compilation, l'analyse et l'interprétation des résultats de recherche ;

4) Collaborer à la formation des étudiants pour l'analyse et la révision des travaux.

Connaissances, habiletés et aptitudes requises



- Maitrise en bioinformatique ou dans un domaine connexe ;

- Maîtrise de français/anglais et bon niveau écrit/oral.

- Fort désir de travailler dans le domaine de la bioinformatique ;

- Expérience avérée en bioinformatique ou en biologie computationnelle ;

- Expérience confirmée en programmation informatique / analyse de données ;

- Expérience confirmée dans l'analyse des données de séquençage de nouvelle génération ;

- Expérience démontrée dans le développement de conceptions d'analyse complexes ;

- Expérience démontrée en informatique haute performance ;

- Expérience démontrée dans la gestion de pipelines sur supercalculateurs ;

- Connaissance d'au moins un langage de script (R, python ou perl) ;

- Connaissance d'un langage de programmation bas niveau (C, C ++ ou Java).



Conditions d'emploi



- Lieu de travail : Centre de recherche du CHU de Québec, site du CHUL;

- Horaire : 25h par semaine de jour (du lundi au vendredi) ;

- Entrée en fonction : dès que possible ;

- Durée : 6 mois (avec possibilité de renouvellement) ;

- Rémunération et avantage sociaux : selon la convention collective en vigueur ;

- Régime d’assurances collectives avec contribution de l’employeur ;

- Régime de retraite (RREGOP) ;

- Privilèges CHU: rabais chez différents partenaires (restaurants, boutiques, conditionnement physique, loisirs, hôtels, centres de santé, spa, etc.), si applicable.



Le genre masculin est utilisé afin d’alléger le texte.

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